Des groupes de travail temporaires (ou des missions) sont constitués sur des sujets novateurs ou sensibles. Ils associent services statistiques et utilisateurs. 

Ils sont chargés d’expertises et formulent des recommandations. Ces groupes de travail sont constitués, en tant que de besoin, après accord du Bureau. Ils sont rattachés à une formation du Cnis à laquelle ils rendent compte périodiquement de l’état d’avancement de leurs travaux. 

Le rapport final du groupe de travail ou de la mission, approuvé par la formation, est publié par le Cnis.